Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CUX2O14529 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CUX2O14529 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUX2O14529 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUX2O14529 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CUX2O14529 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CUX2O14529 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUX2O14529 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms