Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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