Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRPO00591 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRPO00591 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRPO00591 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRPO00591 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms