Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms