Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFS8O00217 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms