Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms