Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms