Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms