Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms