Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL13PA6NNM8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms