Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms