Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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