Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCOF1Q13428 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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TCOF1Q13428 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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TCOF1Q13428 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TCOF1Q13428 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TCOF1Q13428 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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TCOF1Q13428 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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