Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR637-201ENST00000385000 99 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PLA2G12AP1-201ENST00000497678 568 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ASB15-205ENST00000451215 2956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 KANSL2-201ENST00000420613 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR1296-201ENST00000408136 92 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AP002892.2-201ENST00000544195 560 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 COX5AP2-201ENST00000554418 394 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL121928.1-201ENST00000608017 521 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ADGRF4-203ENST00000371220 3075 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ADGRE1-204ENST00000381407 2687 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF143-204ENST00000396604 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 FCAR-202ENST00000353758 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms