Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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