Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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