Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MFAP5-203ENST00000433590 2308 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ZC3H6-201ENST00000343936 11539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SGIP1Q9BQI5 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms