Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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