Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EHF-209ENST00000531728 485 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APOC1P1-204ENST00000575148 560 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf62-210ENST00000577732 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145207.7-201ENST00000580125 958 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL577P-201ENST00000584532 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022031.2-201ENST00000592936 555 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011491.3-201ENST00000595644 559 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001877.1-201ENST00000611253 484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6131-201ENST00000611729 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX41-219ENST00000629036 606 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-239ENST00000640608 3871 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG4-254ENST00000569923 1312 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CD22-202ENST00000341773 2755 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF195-204ENST00000354599 2970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK3-202ENST00000373093 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOT1-210ENST00000581094 3231 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH4-202ENST00000611855 3304 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms