Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms