Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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