Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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