Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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