Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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