Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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