Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD42Q8N9B4 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms