Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms