Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SH3BP4Q9P0V3 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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