Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COG3Q96JB2 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms