Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms