Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HMGB1P1B2RPK0 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HMGB1P1B2RPK0 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms