Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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