Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms