Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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