Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms