Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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LAMA3Q16787 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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LAMA3Q16787 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMA3Q16787 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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