Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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