Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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