Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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VPS72Q15906 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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