Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMB3Q13751 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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LAMB3Q13751 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMB3Q13751 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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