Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2P78314 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2P78314 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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