Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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