Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms