Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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USP31Q70CQ4 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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USP31Q70CQ4 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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USP31Q70CQ4 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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