Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CTXN3Q4LDR2 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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