Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms