Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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