Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SETBP1Q9Y6X0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms