Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC61Q9Y6R9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC61Q9Y6R9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms