Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms